Giải mã gen vi khuẩn Salmonella kháng thuốc từ thân vịt ở Việt Nam

Nghiên cứu tìm hiểu gì?

Salmonella enterica là một trong những tác nhân phổ biến gây bệnh nhiễm khuẩn qua thực phẩm, trong đó gia cầm là nguồn chứa vi khuẩn quan trọng. Việc sử dụng kháng sinh tùy tiện trong chăn nuôi gia cầm ngày càng làm gia tăng tình trạng kháng kháng sinh (AMR), đe dọa sức khỏe của cả động vật và con người. Vi khuẩn kháng thuốc từ gia cầm có thể lây sang người qua tiếp xúc trực tiếp với gia cầm nhiễm bệnh hoặc với môi trường bị nhiễm phân. Salmonella không thương hàn kháng fluoroquinolone nằm trong danh sách các mối lo ngại về sức khỏe toàn cầu của Tổ chức Y tế Thế giới (WHO). Nghiên cứu này công bố dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen và lắp ráp hệ gen de novo của hai chủng S. enterica kháng kháng sinh S8 và S9, được phân lập từ thân vịt Cairina moschata thu thập tại Việt Nam.

Cách thực hiện

DNA hệ gen của S. enterica được tách chiết, sau đó giải trình tự toàn bộ hệ gen bằng nền tảng Illumina MiSeq.

Kết quả chính

Chủng S8 có hệ gen dài 4.707.459 bp, với hàm lượng GC là 52,38% và chứa 10 gen kháng kháng sinh. Chủng S9 có hệ gen dài 4.923.944 bp, với hàm lượng GC là 52,39% và cũng chứa 10 gen kháng kháng sinh.

Ý nghĩa thực tế cho người nuôi

Dữ liệu cung cấp thông tin về các gen kháng kháng sinh của những chủng S. enterica phân lập từ thân vịt, góp phần làm rõ cơ chế nhiễm khuẩn Salmonella kháng thuốc ở người. Đối với người nuôi gà chọi và gà thả vườn, kết quả này nhắc nhở về nguy cơ vi khuẩn kháng thuốc tồn tại trong đàn gia cầm và môi trường chuồng trại, từ đó có thể lây sang người qua tiếp xúc. Người nuôi nên giữ vệ sinh chuồng trại, rửa tay sau khi tiếp xúc với gia cầm và tham khảo ý kiến bác sĩ thú y khi cần dùng kháng sinh cho vật nuôi, nhằm sử dụng thuốc đúng cách và tránh lạm dụng.

Giới hạn của nghiên cứu

Đây là báo cáo dữ liệu hệ gen của hai chủng được phân lập từ một thân vịt, chứ không phải nghiên cứu dịch tễ trên diện rộng. Dữ liệu chủ yếu mô tả đặc điểm hệ gen và các gen kháng kháng sinh, chưa trực tiếp đánh giá hiệu quả của các biện pháp can thiệp hay mức độ lây truyền thực tế trong chăn nuôi.